TP Automne

BCM1521 - Travaux pratiques de biochimie 1 (2 crédits)

Clientèle

Sciences biomédicales

Description

Introduction aux méthodes biochimiques au moyen de travaux pratiques impliquant l’isolement et la caractérisation du glycogène et de l’ADN. Étude spectrophotométrique de la chaîne respiratoire de la mitochondrie, analyse de cinétique enzymatique.

Thèmes

  • Glycogène : À partir d’un morceau de foie de bœuf, faire l’étude des propriétés physiques et chimiques de ces polysaccharides (glycogène)
  • ADN : À partir d’un morceau de thymus de veau, isoler l’ADN pour ensuite effectuer l’analyse physico-chimique et l’analyse par électrophorèse de l’ADN
  • Mitochondries : Mettre en évidence un changement spectral des intermédiaires de la chaîne de transport d’électrons des mitochondries de cœur de porc en les réduisant par le succinate en présence de cyanure
  • Phosphatase : À l’aide de la phosphatase alcaline de foie de veau, nous étudions l’effet de la concentration d’enzyme sur la vitesse de la réaction enzymatique, l’effet du pH sur la vitesse de la réaction, l’effet de la concentration du substrat et d’un inhibiteur sur la vitesse de la réaction. Application des équations suivantes : Michaelis-Menten et sa double réciproque (Lineweaver-Burk) afin d’évaluer le KM, Vmax et KI de l’enzyme

BCM2531 - Travaux pratiques 2 (2 crédits)

Clientèle

Biochimie

Description

Introduction à la biologie moléculaire. Sous-clonage de gène dans un vecteur d’expression. Analyse de production de protéine. Amplification de gêne par PCR, méthodes d’analyses radioisotopiques, analyses de l’ADN, manipulations de microorganismes

Thèmes

  • Clonage dans un vecteur d’expression
  • Transformation d’un plasmide recombinant
  • Isolement et analyse de plasmides recombinants
  • Southern Blot et PCR : Méthodes d’analyses radio isotopiques et par PCR
  • Expression protéique via E. coli et Séquençage d’ADN

BCM3531 - Travaux pratiques 3 (3 crédits)

Clientèle

Biochimie

Description

Apprentissage de techniques de pointes en biologie moléculaire (Mutagenèse dirigée, Hybridation moléculaire, qPCR, Séquençage), en expression cellulaire (culture cellulaire, microscopie) et en études des protéines (Western Blot, cinétique enzymatique, pharmacocinétique, purification de protéines sur tamis moléculaire, échangeuse d’ions et affinité (AKTA)). En fin session, conception d’un protocole utilisant les techniques étudiées au cours du baccalauréat par l’approche d’apprentissage par problèmes.

Thèmes

  • Mutagénèse/qPCR : introduire une mutation au niveau d’un gène en effectuant une seule réaction de PCR. Analyse d’expression d’un gène via la technique du qPCR
  • Purification de la bêta-galactosidase : familiarisation avec quelques techniques de base de la purification et d’analyse des protéines
  • Liaisons macromoléculaires : quantifier la liaison ADN-protéine du système LacI LacO à l’aide de 3 approches (EMSA, FP et DNA pulldown)
  • Microscopie
  • APP : Rédaction d’un protocole pour ensuite l’expérimenter en laboratoire et ainsi arriver à réussir l’extraction, la purification et la caractérisation d’une polymérase en laboratoire

MMD1032 - Biologie moléculaire de la cellule (3 crédits)

Clientèle

Médecine

Description

Introduction aux techniques de base en médecine moléculaire au moyen de travaux pratiques impliquant l’isolement de l’ADN plasmidique et l’utilisation d’enzymes de restriction et d’électrophorèse pour cartographier le plasmide recombinant

Thèmes

  • Initiation à la manipulation des différents pipetmans
  • Isoler de l’ADN plasmidique
  • Utiliser des d’enzymes de restriction pour cartographier un plasmide
  • Visualiser les fragments d’ADN sur Électrophorèse d’agarose