Hiver

BCM1521 - Travaux pratiques de biochimie 1 (2 crédits)

Clientèle

Biochimie/Bio-informatique

Description

Introduction aux méthodes biochimiques au moyen de travaux pratiques impliquant l’isolement et la caractérisation du glycogène et de l’ADN. Étude spectrophotométrique de la chaîne respiratoire de la mitochondrie, analyse de cinétique enzymatique.

Thèmes

  • Amylase salivaire : À partir de leur propre enzyme amylase salivaire, les étudiants sont appelés à développer un mini protocole pour le dosage de cette enzyme dans leur salive
  • Amplification d’ADN VNTR: À l’aide d’une approche de PCR spécifique au VNTR, les étudiants vont amplifiés leur propre matériel génétique à partir de l’extraction d’ADN de cellules buccales et par l’approche VNTR, ils pourront visualiser leur propre ADN après électrophorèse sur gel d’agarose et valider le nombre de répétitions propres à chacun.
  • Purification de la Taq polymérase: À partir d’un culot bactérien, les étudiants seront initiés aux rudiments de la purification de cette protéine aux caractéristiques physico-chimiques intéressantes. Techniques spécialisées de purification d’une protéine thermostable.
  • Phosphatase : À l’aide de la phosphatase alcaline de foie de veau, nous étudions l’effet de la concentration d’enzyme sur la vitesse de la réaction enzymatique, l’effet du pH sur la vitesse de la réaction, l’effet de la concentration du substrat et d’un inhibiteur sur la vitesse de la réaction. Application des équations suivantes : Michaelis-Menten et sa double réciproque (Lineweaver-Burk) afin d’évaluer le KM, Vmax et KI de l’enzyme
BCM2532 - Pratique de la communication en sciences (2 crédits)
BCM3531 - Travaux pratiques 3 (3 crédits)

Clientèle

Biochimie

Description

Apprentissage de techniques de pointes en biologie moléculaire (Mutagenèse dirigée, Hybridation moléculaire, qPCR, Séquençage), en expression cellulaire (culture cellulaire, microscopie) et en études des protéines (Western Blot, cinétique enzymatique, pharmacocinétique, purification de protéines sur tamis moléculaire, échangeuse d’ions et affinité (AKTA)). En fin session, conception d’un protocole utilisant les techniques étudiées au cours du baccalauréat par l’approche d’apprentissage par problèmes.

Thèmes

  • Mutagénèse/qPCR : introduire une mutation au niveau d’un gène en effectuant une seule réaction de PCR. Analyse d’expression d’un gène via la technique du qPCR
  • Purification de la bêta-galactosidase : familiarisation avec quelques techniques de base de la purification et d’analyse des protéines
  • Liaisons macromoléculaires : quantifier la liaison ADN-protéine du système LacI LacO à l’aide de 3 approches (EMSA, FP et DNA pulldown)
  • Microscopie
  • APP : Rédaction d’un protocole pour ensuite l’expérimenter en laboratoire et ainsi arriver à réussir un projet en édition de génome utilisant l’approche CRISPR-Cas9